主要因为三方面的因素
1、种衣剂的主要成份
种衣剂的主要成分包括杀虫剂、杀菌剂及微量元素，是药剂和肥料的复合剂。不同的种衣剂其侧重点不同，有的是病害与虫害同时预防，有的是侧重于防虫如地下害虫，有的是侧重于防病如预防丝黑穗病。同时还可补充田间缺乏的微量元素，增强种子活力的作用。
2、企业对种衣剂的选择
不同品种抗病能力及抗虫能力不同，所以企业对不同品种所选择的种衣剂是有差别的。
如品种不抗丝黑穗病，那么企业在选择种衣剂时就会侧重于防治丝黑穗病，并且好的种衣剂对丝黑穗病的预防率可达到85%以上。另外，企业也会针对不同区域发病情况适当调整种衣剂的成份，如有的区域病害较轻，而虫害较重，那么种衣剂的选择就会偏向预防害虫，尤其是地下害虫，所以说为了预防病害或虫害，企业选择种衣剂针时对性很强。
3、种植户对种子的选择
品种同质化严重，田间表现差异不大，尤其是风调雨顺的年份差异更小。所以有的种植户选择种子时以价格高低来决定，“高价种子和低价种子没有区别”，而忽视了对种衣剂成份的选择。殊不知这样的选择在病害或虫害暴发年份会带来无限有麻烦和经济损失。
