保护地茄子易发生的虫害主要有红蜘蛛、茶黄螨、蚜虫等，病害主要有茄绵疫病、褐纹病、黄萎病等。
（1）红蜘蛛 又名火蜘蛛，虫体为红色或橘红色，成虫和若虫在叶背面吸食汁液，被害叶面出现黄白色斑点，严重时叶片变黄枯焦。
预防红蜘蛛应加强中耕，消除杂草，减少虫源，发现田间有虫害及时喷药防治。常用药剂有：40%乐果乳油1000倍液，20%双甲脒乳油1000～2000倍液，50%敌敌畏乳油800倍液，50%三氯杀螨醇乳油1000倍液，每隔7天喷1遍，喷2～3次。
（2）茶黄螨 虫体小，肉眼看不出。茶黄螨繁殖速度快，若防治不及时则迅速蔓延。
茶黄螨主要以成螨在温室和塑料大棚内越冬，靠风吹和自己爬行传播。成螨和幼螨集居在植株幼嫩部位刺吸汁液。被害部位表皮细胞木栓化，呈灰褐色或灰白色，增厚变硬。叶片被害后停止生长，叶背面变成茶褐色，叶缘向背面卷曲。
当发现田间个别植株嫩叶有变小增厚，发硬、叶背油浸状时，立即用药防治。可用3%的克螨特乳油1500倍液，40%的乐果乳油1000倍液，20%的三氯杀螨醇乳剂1000～1500倍液喷洒植株。喷药重点部位是植株的上部嫩叶、茎及生长点、花蕾和幼果。
（3）蚜虫 喜食番茄嫩叶及生长点，以成蚜和若蚜群集在叶背吸食汁液，分泌蜜露，使叶片皱缩卷曲、变黄。
蚜虫主要分布在叶背面，因而叶背是防治重点。防治蚜虫应选择不同性质的农药交替使用，以提高药效。
防治蚜虫可利用蚜虫对黄色、橙色的趋性特点，在黄色或橙色纸板上涂抹废机油诱杀有翅蚜。也可用40%的乐果乳油1000～1500倍液，20%的氧化乐果乳油1000～2000倍液，50%马拉硫磷乳油1500～2000倍液，2.5%的敌杀死乳油3000倍液防治。
（4）茄子绵疫病 保护地茄子主要病害之一，主要危害果实，也危害茎叶。受害部分以老熟果实为主，发病初期病部生水浸状圆形小斑，最后扩展到整个果实，病部逐渐收缩、变软，表面出现皱褶。高温条件下病部生出浓密的白色绵毛状菌丝，果肉变黑腐烂。
此病在高温高湿条件下容易发生流行。因此保护地栽培茄子应控制空气湿度，及时摘除老叶，以利通风透光，减少病害发生。发病初期用58%的瑞毒锰锌400倍液，75%的百菌清液500～600倍液，25%的瑞毒霉800倍液，40%乙膦铝200倍液，每隔7～10天喷1次，连喷2～3次。
（5）茄子褐纹病 主要危害茎、叶及果实。
叶受害初生白色小点，后扩大为不规则形病斑，中部浅褐色，边缘暗褐色。茎被害后病斑棱形，边缘深褐色，中间黑白色。果实被害初生褐色圆斑，稍凹陷，病斑表面轮状排列许多小黑点。发病期整个果实腐烂，常脱落或干瘪悬挂在枝上。
预防茄子褐纹病应实行3年以上轮作，进行种子消毒和苗床灭菌。进入结果期及时摘除病叶、病果。喷施65%代森锌500倍液，70%代森锰锌400～500倍液，75%百菌清液可湿性粉剂600倍液，每7～10天喷1次。
（6）茄子黄萎病 一般在门茄坐果后开始发病。发病先从下部叶片开始，叶脉间变黄，叶片萎蔫，以后上部叶片也逐渐萎蔫，病株果实变小变硬，受害严重时全株枯死。剖开根、茎及叶柄，可见维管束呈褐色。
茄子黄萎病应以防为主，注意轮作倒茬，增施有机肥。定植茄子前可用2～2.5千克50%的多菌灵可湿性粉剂喷洒地面，翻入地下25厘米深处。也可在定植时用50%的多菌灵可湿性粉剂灌根，每株灌药0.3～0.5千克。
